Masalah-masalah yang Timbul daripada Kepincangan Sistem Pembelajaran

1) Krisis Identiti: Para pelajar tidak menyedari kepentingan jati diri sebagai seorang muslim dalam sebuah masyarakat intelek.

2) Anti-Tauhid: Para pelajar tidak mencapai Ma’rifatullah walaupun sudah banyak menguasai ilmu pengetahuan.

3) Minda-Barat: Para pelajar lebih suka mencontohi nilai kebudayaan Barat kerana mereka menyangka tamadun Barat adalah pemimpin dalam tamadun ilmu.

4) Krisis-Nilai: Para pelajar tidak dapat menjadikan para guru sebagai contoh dalam akhlak lalu membentuk suatu persepsi bahawa akhlak mulia hanyalah suatu teori dan khayalan yang bersifat tidak praktikal dan tidak relevan.

5) Jiwa Materalistik: Para pelajar akan menjalani kehidupan secara individualistik kerana sibuk mengejar kepentingan material lalu mengabaikan tanggungjawab terhadap agama dan masyarakat.